每周好文早期肺癌演变中的ctDNA进

拓普基因，精准医疗行业领导者，她制造每一种产品的精神均基于有一天我们自己可能会用得到她。

研究背景

1、肺癌是世界上最凶险癌症之一，肺癌导致的死亡人数在所有癌种里面最多。肺癌一旦转移很难治愈，临床数据显示术后辅助化疗总生存只有5%获益。

2、非小细胞肺癌的瘤内异质性和肿瘤进化的深入探索仅限于回顾性队列研究，基于ctDNA动态监测的液体活检技术与早期肺癌复发转移之间的关系也没有建立。

3、类似的研究已经在乳腺癌和结直肠癌中开展，肿瘤负荷小和瘤内异质性低的似乎是对生存有益的，使用ctDNA非侵入性方法追踪肺癌进化动态及对复发预测的研究需进一步探索。

研究方法

1、TRACERx（TrackingNon-Small-CellLungCancerEvolutionthroughTherapy）：英国政府在年启动的关于非小细胞肺癌的大型前瞻性临床研究，意图从患者被诊断那一天开始采集患者的样本，分析患体内的基因变化，一直到患者死亡，探寻肿瘤异质性对治疗和预后的影响。

2、本研究对前个招募到TRACERx试验患者的血样，使用Natera的mPCR（multiplex-PCR）技术分析他们的血液样本ctDNA，研究ctDNA进化图谱、克隆SNVs、肿瘤体积VAF和进化特征等。

3、本文提供非小细胞肺癌初次术后早期监测复发以及对新的亚克隆播散转移位点监测，以期为控制肿瘤复发提供新的治疗方式。

结果

一：ctDNA进化图谱

TRACERx研究监测的是NSCLC患者从诊断到死亡的克隆演化，采用多区域（R1~R4）外显子测序建立进化树，对早期NSCLC的ctDNA谱统计分析进化树。对于每个患者综合使用给定的多重PCR分析板，血浆中选择靶向克隆与亚克隆SNVs追踪进化树的分支。

二：敏感性和特异性分析

分析确认了多重PCRNGS平台在SNVs频率超过0.1%时候敏感性达到99%以上，特异性99.6%，敏感性定义在2个SNVs阈值。

三：影响ctDNA检测的相关因素分析

对分期、坏死、PET、Ki67%、淋巴结侵犯、淋巴管侵犯、肿瘤大小与ctDNA关系分析。48%的患者（46/96）在早期NSCLC外周血ctDNA中检测到至少2个SNVs，有12个患者检测到至少1个SNVs。

四：分期与ctDNA关系

在检测到的SNVs中97%的患者（30/31）是肺鳞癌，71%（5/7）是其他类型，而肺腺癌只有19%（11/58），I期鳞癌中ctDNA检测出94%的患者（16/17），而相对I期腺癌只有13%（5/39）。

五：肿瘤坏死与ctDNA关系

ctDNA与肿瘤坏死也有关，ctDNA部分是由于坏死后释放到外周血中，而这也与鳞癌的生物特性坏死较多相符合。肿瘤活性越高（PET）、增殖约活跃（Ki67%）、高危（淋巴结侵犯、淋巴管侵犯），ctDNA释放到外周血更多。

六：术后ctDNA检测反应化疗疗效

图a-c：术后化疗后ctDNA水平上升，且术后有检测到的在一年内都复发了，可见ctDNA能反应化疗的耐药。

图b：术后化疗后在第天查血ctDNA和胸部CT，，CT怀疑有病灶，而且ctDNA也是高的，在天证实复发。

七：术后ctDNA检测预测NSCLC复发

图d：SNVs的检测早于临床上CT发现的肺癌复发（fig4a~g），平均早70d，甚至有些能在1年前就预示着肿瘤复发。

图e：术前颅内评估无转移，但是术后ctDNA一直存在，在术后54天确实诊断为颅内转移，可见ctNDA反应了潜在转移灶。

图h：对于术后一直没有复发的患者血中ctDNA一直是阴性的。

八：确认亚克隆ctDNA进化

对CRUK这个患者进行分析，IIa期术后椎旁复发，对原发肿瘤和转移肿瘤进行外显子分析，转移肿瘤的ARID1A并没有在原发肿瘤中检测到，在原发组织包含的OR5D18可能是导致转移的亚克隆。对术前血和术后血靶向测序，发现术后SNV同样多了ARID1A，而术前血包含有OR5D18。这些数据表明，ctDNA可以反应在原发性肿瘤区域中潜在存在的转移亚克隆驱动群。

结论

1、采用靶向测序panels，ctDNA分析能描述出肿瘤原发灶和转移灶的克隆和亚克隆，可以反应在原发性肿瘤区域中潜在存在的转移亚克隆驱动群；

2、多重PCRNGS平台在SNVs频率超过0.1%时候敏感性达到99%以上，特异性99.6%；

3、ctDNA能反应非腺癌、坏死、高增殖、淋巴结侵犯情况；

4、ctDNA可以用于监测克隆进化，反应化疗耐药及追踪肿瘤复发。

小拓有话说：

拓普基因覆盖个基因，种药物，53万个基因位点的检测。通过全面检测抗肿瘤靶向药物的靶点基因、相关基因、肿瘤驱动基因等，解读基因与药物之间的关系，辅助医生根据肿瘤患者个体差异，选择合适药物，以延长患者生命，提高患者生活质量。

更多精彩内容敬请







































治疗白癜风最好的医院
哪专治白癜风