非小细胞肺癌分子和生物标志物分析原则,建
2022-8-18 来源:本站原创 浏览次数:次福利(点击下方链接,回复关键词,免费获取指南):
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本文摘自:.v5版非小细胞肺癌NCCN指南
已确定多种基因改变可影响治疗选择。检测肺癌标本的这些改变,对于确定潜在有效的靶向治疗以及避免不太可能提供临床益处的治疗非常重要。
01.分子学检测主要因素
?对分子结果的应用与解释至关重要的分子学检测主要因素包括:
使用适当认可的实验室,至少有CLIA认证
了解所使用的方法以及这些方法的主要局限性
了解通过特定分析检测(和未检测)的变化范围
在检测前,了解肿瘤标本是否进行过病理学检查和肿瘤富集(即显微解剖、肉眼分离)
检测实验室接受的样品类型
02.标本采集和管理
?标本采集和管理:
虽然肿瘤检测已主要集中于使用FFPE组织,但越来越多的实验室接受其他类型的标本,特别是未通过FFPE法处理的细胞病理学标本。尽管FDA批准的多种伴随诊断检测不包括细胞块检测,但如果它是唯一的或最好的材料,强烈建议对这些标本进行检测。
使用微创技术获取标本用于NSCLC分子检测结果时,一个主要局限性是获得的组织标本可能不足以进行分子、生物标志物以及组织学检测。因此,为了能够进行所有合适的检测,支气管镜医生和介入放射科医生应获取足够的组织。
当组织极少时,实验室应采取技术以最大限度地获得用于分子和辅助检测的组织,包括专门的小活检组织学流程、包括用于诊断和预测性检测的“预”切片。
04.检测方法
下文分别逐一列举适当可行的检测方法的指征;但通常考虑使用几种方法:
?用于临床实验室的二代测序(NGS)。单独NGS分析并不能检出所有类型的改变,重要的是熟悉单独分析或联合分析可识别的改变类型。
?如果可行,推荐此时通过广泛的基于专家组的方法进行检测,最常用NGS。对于广泛检测无可识别的驱动癌基因的患者(尤其是从不吸烟的患者),考虑基于RNA的NGS(如果尚未进行),以最大程度检测融合事件。
?实时聚合酶链反应(PCR)可高度针对性地使用(针对特定突变)。采用该技术只能针对特定的改变进行检测评估。
?桑格测序要求最大程度的肿瘤富集。未改良的桑格测序不适合检测富集后肿瘤标本中肿瘤仍不足25%至30%的突变检测,重要的是也不适于检测识别亚克隆事件(如耐药突变)。如果使用桑格测序,几乎总是推荐使用肿瘤富集方法。
?可采用其他方法,包括上文未列出的复合方法(即SNaPshot、MassARRAY)。
?荧光原位杂交(FISH)分析用于拷贝数、扩增以及结构改变如基因重排等许多分析检查。
?IHC专用于某些特定分析,可作为一个有用的替代或其他分析的筛选方法。
长按