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揭秘东亚非吸烟肺癌的蛋白质基因组学描述发病机制和进展的分子特征

本篇探究的是非吸烟肺癌早期的临床特征和发展过程中的分子标志物，作者采用基因组、全外显子、转录组、蛋白质组学、磷酸化修饰组学分析探究了早期非吸烟肺癌患者的4大问题：

1.东亚肺腺癌的蛋白质组学景观凸显了人口统计学差异和进展标志；

2.基因组改变对LUAD蛋白质组的影响；

3.与内源性和环境突变和蛋白基因组学影响相关的突变概况；

4.蛋白质组亚型展现了早期肺腺癌的异质性；

本文应用多组学研究描绘了不同的分子属性和肿瘤进展的标志。确定了年龄、性别相关的内源性和环境致癌物诱变过程。是东亚地区第一个非吸烟肺腺癌的深度多组学研究。作者收集了来自台湾的例肺腺癌患者（TW队列）的匹配肿瘤和正常组织，进行外显子组测序（WES）、RNA-seq、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学检测。基因组分析鉴定出个非同义的体细胞单核苷酸变异（SNV），在转录水平定量了个RNA，蛋白质谱定量了多种独特的蛋白质和个磷酸位。

之前和大家主要分享了基因突变情况和肿瘤的转录、蛋白、磷酸化的分子表达特征，及肿瘤发展过程中的动态变化分析做了探讨,下面主要介绍研究成果的后两大点探究：

探究内外突变因素对突变谱及蛋白水平的影响分析

CT转换的高比例与APOBEC突变特征有关，因此该研究重点